Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRRT4C9JH25 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRRT4C9JH25 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRRT4C9JH25 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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