Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEMP2A6NFY4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms