Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms