Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms