Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms