Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT82Q9NSB4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms