Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KIAA1549Q9HCM3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms