Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD4Q76G19 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms