Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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