Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPPQ16740 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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