Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms