Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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