Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms