Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.185e-10■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 CRACR2B-204ENST00000527089 824 ntTSL 320.25■□□□□ 0.835e-10■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-10■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 BMP1-215ENST00000522332 1337 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -08e-8■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 BMP1-212ENST00000520982 3244 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.358e-8■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-11■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■■□□□ 13.6
PCBP2Q15366 AL645568.1-201ENST00000367716 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-7■■□□□ 13.6
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PCBP2Q15366 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.149e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.849e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 BTBD7-204ENST00000553975 2479 ntTSL 28.92□□□□□ -0.989e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 BTBD7-203ENST00000355125 6822 ntTSL 24.89□□□□□ -1.639e-7■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.532e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-8■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-8■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-9■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 IST1-225ENST00000568581 503 ntTSL 513.85□□□□□ -0.196e-12■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.96e-12■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.113e-20■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.67e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-8■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 315.25■□□□□ 0.037e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 EIF2B5-209ENST00000481054 3460 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.192e-8■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 EIF2B5-210ENST00000484154 449 ntTSL 310.32□□□□□ -0.762e-8■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 USP11-211ENST00000489111 516 ntTSL 39.79□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 13.5
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PCBP2Q15366 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.391e-12■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.11e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 EP400-202ENST00000332482 2588 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 GTPBP6-202ENST00000485332 2016 ntTSL 218.51■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 TJP2-204ENST00000413932 822 ntTSL 317.97■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.398e-7■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-15■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.96■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 GLMP-208ENST00000481050 684 ntTSL 316.93■□□□□ 0.32e-15■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 GLMP-205ENST00000476177 795 ntTSL 516.59■□□□□ 0.252e-15■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-15■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 13.5
PCBP2Q15366 ESPN-207ENST00000475228 813 ntTSL 516■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 13.5
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