Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms