Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms