Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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