Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGCGQ13326 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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