Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TRAF1Q13077 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF1Q13077 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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