Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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