Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF5P84085 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms