Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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