Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPAP53621 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPAP53621 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms