Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV1P49821 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms