Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCAMP43121 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms