Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBRP36941 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms