Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NFKBIAP25963 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms