Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms