Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms