Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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