Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RALAP11233 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RALAP11233 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RALAP11233 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms