Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms