Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC172P0C7W6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms