Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI1P08151 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms