Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOP08100 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOP08100 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOP08100 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms