Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA4P06727 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms