Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F9P00740 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F9P00740 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F9P00740 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms