Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms