Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC28A2O43868 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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