Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRTO14522 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms