Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms