Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms