Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms