Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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