Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIST3H3Q16695 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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HIST3H3Q16695 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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HIST3H3Q16695 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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