Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ZNF239Q16600 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ZNF239Q16600 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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