Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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