Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE3CQ15386 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms