Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNIP1Q15025 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms