Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNW1Q13573 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms